Ich habe beim ersten Versuch die milestone_root.zip mit dem Gerät über das HSDPA Netz runtergeladen und umbenannt.

Das kann ich nicht empfehlen, das Flashen ging nicht.
Im 2ten Versuch (lokal runterladen, umbenennen und per Kabel auf das Gerät kopieren) hat es dann funktioniert.

@andreasg.
Diese Meldung bekomme ist kein Problem,
root–Rechte solltest du trotzdem haben.