Wenn ich das richtig verstanden habe kann es unter Umständen dazu kommen, dass eine Verbindung nicht sofort getrennt wird nachdem man die "Deaktivierung" via APNDroid vorgenommen hat.
Wenn also eine Applikation diese bestehende Verbindung gerade benutzt und du mittels APNDroid das APN-Profil "unbrauchbar" machst, dann bleibt diese Verbindung erst einmal bestehen. Sie wurde ja mit dem "noch brauchbaren" initiiert. Und so Daten fließen, wird eine Verbindung nicht getrennt.

Nur eine Vermutung.

? Ist es immer so, dass GPRS/EDGE/HSDPA-Symbol kommt sobald kein WLAN da ist ? Oder war es nur einmal zu Anfang ?

Und die 103kb unter GSM sind Daten, welche über GPRS, EDGE oder HSDPA geflossen sind, sonst nichts.